Naskita en Como, Italio en 1702 de nobla naskiĝo. En Hispanio, kie li alvenas fuĝante de la milito en Aŭstrio, li ricevas larĝajn potencojn kolekti en la Reĝaj Kaŝoj de Meksiko la pension de la posteuloj de Moctezuma.
Li vojaĝis al Nova Hispanio en 1736. Dum la ok jaroj de sia restado li dediĉis sin al esplorado de la aperoj de la Virgulino de Gvadalupo, kolektante konsiderindan grafikan kaj piktografian materialon. Ĝi antaŭenigas la kronadon de la Guadalupan-bildo, kiu kaŭzas malfidon al la vicreĝaj aŭtoritatoj. Li estas kaptita kaj lia kolekto estas senvestigita. Monatojn poste, deportita al Hispanio, li enŝipiĝas sur ŝipo, kiu falas en la manojn de la piratoj, kiuj forlasas lin en Ĝibraltaro.
Per bonegaj verkoj li alvenis en Hispanion kaj ekkontaktis kun la kolektanto Mariano Fernández de Echeverríay Veytia, kiu atingis sian malkondamnon nomumante Reĝa Kronikisto de la Indioj, posteno, kiun Boturini malakceptis dediĉi al verkado pri la historio de indiĝenaj popoloj. Kvankam li neniam retrovas sian kolekton, li verkis la Katalogon de la Hinda Muzeo sur ĝi. Lia verko estas tre originala kaj bone dokumentita. Li mortis en Madrido en necerta dato, inter 1750 kaj 1755.
